В России создана Национальная база данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2
В России создана Национальная база данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2
18.06.2021 2703
В России создана Национальная база данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2. Разработчиком этой программы и консолидирующим центром стал Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. Ее платформа при необходимости может быть использована как база для мониторинга за другими инфекциями.
В ЦНИИ эпидемиологии разработана и введена в действие платформа «VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia). Сервис RuStrain». Платформа включает в себя базу данных и программное обеспечение, позволяющее осуществлять агрегацию информации о геномах вирусов, сортировать, характеризовать и анализировать поступающие данные. Об этом сообщается на портале Роспотребнадзора.
«До сих пор информация о мутациях (геномных последовательностях) вируса SARS-CoV-2 из России была разрозненной, что в условиях продолжающейся пандемии, безусловно, является тормозящим фактором в борьбе с новой коронавирусной инфекцией», – указано в сообщении.
База данных VGARus содержит информацию о нуклеотидных последовательностях вирусов SARS-CoV-2 и их мутациях, распространенных в тех или иных регионах России, и может быть использована для хранения, систематизации и выборки данных для выявления мутаций и определения штаммов вирусов.
Программное обеспечение, интегрированное в платформу VGARus, позволяет анализировать результаты секвенирования, определять вероятный штамм вируса, формировать стандартизированные отчеты, загружать образцы, предназначенные для дальнейшего секвенирования.
Доступ к платформе осуществляется через портал genome.crie.ru.
В настоящее время все научные учреждения страны, занимающиеся секвенированием геномов коронавируса и зарегистрировавшиеся на портале в качестве пользователей, могут выложить изучаемые геномные последовательности в Национальную базу данных. Полученные регистрационные удостоверения позволяют предоставить зарегистрированным пользователям возможности пользоваться информацией из базы данных.
Кроме того, данная платформа при необходимости может быть использована как база для мониторинга за другими инфекциями.
В середине февраля президент Владимир Путин поручил правительству расширить и профинансировать научно-практические исследования по расшифровке (секвенированию) геномов циркулирующих в России и в мире возбудителей инфекций, а также провести дополнительные исследования эффективности вакцин против новых штаммов коронавируса.
23 марта премьер-министр Михаил Мишустин подписал постановление № 448, в соответствии с которым федеральные и региональные организации, проводящие молекулярно-генетические исследования вирусов, должны направлять информацию по расшифровке генома возбудителя коронавируса в ЦНИИ эпидемиологии в течение суток с момента их получения.
24 мая глава правительства подписал распоряжение № 1339, в соответствии с которым Роспотребнадзор получит из резервного фонда правительства 3 360 153,2 тыс. руб. Из этой суммы 400 млн руб. должно быть направлено на проведение секвенирования геномов 48 тыс. проб с образцами коронавируса.
Источник: ( Ссылка )
