Об анализе научной статьи об эволюции нового коронавируса

image

17.03.2020 136

Группой авторов (Yvonne CF Su, Danielle E Anderson, Barnaby E Young, Feng Zhu и др.) из Национального центра инфекционных заболеваний и института глобального здоровья Республики Сингапур на сайте https://www.biorxiv.org/ 11 марта 2020 года был представлен препринт статьи «Обнаружение делеции 382 пн на ранней стадии эволюции SARS-CoV-2» (Discovery of a 382-nt deletion during the early evolution of SARS-CoV-2, bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.11.987222 ).

Группой авторов (Yvonne CF Su, Danielle E Anderson, Barnaby E Young, Feng Zhu и др.) из Национального центра инфекционных заболеваний и института глобального здоровья Республики Сингапур на сайте https://www.biorxiv.org/ 11 марта 2020 года был представлен препринт статьи «Обнаружение делеции 382 пн на ранней стадии эволюции SARS-CoV-2» (Discovery of a 382-nt deletion during the early evolution of SARS-CoV-2, bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.11.987222 ).

В данной работе авторы сообщают об открытии ими первой крупной мутации в геноме вируса SARS-CoV-2 за весь период его наблюдения. Найденная мутация представляет собой крупную делецию (размером 382 пн) в нуклеотидной последовательности генома вируса. В геноме вируса SARS-CoV-2 данная мутация приводит к полному удалению гена Orf8, этот ген играет вспомогательную роль и отличается высокой изменчивостью. Авторами приводиться предположение, что удаление гена Orf8 из генома вируса SARS-CoV-2 является первым значительным проявлением в адаптации данного вируса к организму человека. Развивая это предположение, авторы ссылаются на ряд научных статей посвященных эволюции генома вируса SARS вызвавшего вспышку атипичной пневмонии в Китае в 2003-2004 годах [1, 2]. В случае генома вируса SARS было установлено, что кодирующая последовательность гена Orf8 претерпела постепенное удаление во время вспышку атипичной пневмонии среди людей. Геномы вируса SARS на ранних этапах вспышки атипичной пневмонии содержали полный ген Orf8, который также присутствует в геномах почти всех вирусов-предшественников (переносимых летучими мышами и плотоядными животными) установленных для SARS. Делеция 29 нуклеотидов в пределах гена Orf8 произошла во всех штаммах SARS, вовлеченных в среднюю и позднюю фазу атипичной пневмонии в Китае в 2003-2004 годах среди людей. В поздней фазе вспышки атипичной пневмонии в выделенных штаммах SARS-CoV ген Orf8 часто отсутствовал целиком с прилегающими к нему областями. Предполагается, что частичная или полная делеция гена Orf8 приводит к уменьшению способности вируса к репликации (размножению) и ослаблению его вирулентных свойств (аттенуации) [1, 2].

Используя эти ранее полученные данные при изучении адаптации вируса SARS во время вспышки атипичной пневмонии в Китае в 2003-2004 годах, авторы статьи предполагают, что выявленная ими полная делеция гена Orf8 у трех вариантов генома вируса SARS-CoV-2, так же является началом радикального изменения свойств этого вируса в процессе его приспособления к организму человека.

Проведенный научными учреждениями Роспотребнадзора анализ показал наличие делеции размером 382 пн в нуклеотидной последовательности генома вируса SARS-CoV-2 только в трех его вариантах, выделенных из клинического материала (17-19 февраля 2020 года) от пациентов в Сингапуре. Из доступных на сегодняшний день 516 геномонов вируса SARS-CoV-2 (https://platform.gisaid.org) за период выделения с 24 декабря 2019 по 09 марта 2020 года только в этих трех вариантах генома вируса имеется данная делеция. В остальных 513 геномах наблюдаются только единичное мутации.

Таким образом, на сегодняшний день нет доказательств дальнейшего эволюционного развития генома вируса SARS-CoV-2 в данном направлении.

Список используемой литературы:

1. Chinese, S.M.E.C., Molecular evolution of the SARS coronavirus during the course of the SARS epidemic in China. Science, 2004. 303(5664): p. 1666-9.

2. Muth, D., et al., Attenuation of replication by a 29 nucleotide deletion in SARS-coronavirus acquired during the early stages of human-to-human transmission. Sci Rep, 2018. 8(1): p. 15177.

Источник : Ссылка

   


Другие публикации в этой рубрике: Новости
Для размещения Вашей информации на портале воспользуйтесь системой "Public MEDARGO"
Альбумин раствор для инфузий 10% фл. 100мл

Пространство дискуссий

image
В Москве дан старт пилоту дистанционного отслеживания состояния здоровья беременных
image
Аптека выплатила москвичке два миллиона рублей за продажу фальсифицированного онкопрепарата
image
Система маркировки поможет оперативно контролировать цены на лекарства
image
Пока россияне увлекаются самолечением, количество аптек в стране будет расти
image
Недобросовестных поставщиков отлучат от участия в закупках
image
Следственный комитет взял под контроль уголовные дела против косметологов
image
Власти пообещали ликвидировать медицинские недострои до 2027 года
image
В 2025 году стартует новый нацпроект “Продолжительная и активная жизнь”

Медицинский видеолекторий

image
Инсулинорезистентность: особенности заболевания и возможности коррекции
image
Главное правило долгожителей и просто здоровых людей – пить много воды, но обязательно учитывать коэффициент диссимметрии
image
Преждевременное старение и какое влияние на этот процесс оказывают AGEs (конечные продукты гликирования)
image
Нелинейная медицина в современной жизни

PROздоровье

image
Назван способ справиться с эмоциональным всплеском для подростков
image
Врач дал 3 совета, как до лета успеть избавиться от пивного живота
image
Яйца не повышают уровень холестерина, выяснили ученые
image
Подмосковные врачи рассказали, как избежать переутомления и эмоционального выгорания
image
Как выбрать хороший вкусный виноград
image
Врач-оториноларинголог рассказала, как сохранить слух
image
Ученые выделили факторы, приводящие к раннему старению мозга
image
Психолог рассказала, как справиться с тревогой в общественных местах
image
В Роспотребнадзоре напомнили, как хранить яйца и проверять их на свежесть
image
Названы причины снижения ловкости рук в пожилом возрасте
image
Дерматолог назвала причины морщин на переносице
image
Покалывание в руках: причины возникновения и лечение
image
Диетолог назвала самые вредные сочетания продуктов
image
Эксперт гормональной терапии назвал пять причин хронической бессонницы
image
Польза и вред халвы для организма человека
image
Елена Малышева назвала три продукта, которые обязательно нужно есть во время Великого поста

Новости

image
Правительство утвердило обновленный перечень маркируемых БАД и антисептиков
image
Аптеки предупредили об увеличении оснований для внеплановых проверок
image
В 2023 году в России создали 13 вакцин от опасных болезней животных
image
Минздрав сообщил об обеспеченности лекарствами пациентов с ВИЧ
image
29 марта 2024 года в 11:00 приглашаем налогоплательщиков принять участие в вебинаре
image
В прошлом году в Подмосковье количество партнерских родов выросло до 30%
image
Почти 150 пациенток прошли лечение в Центре эндометриоза областного НИИ акушерства и гинекологии
image
БАД, от которого в Японии умерли уже четыре человека, спокойно продается в российских интернет-магазинах
image
Люберецкие врачи спасли пациента с ножевым ранением сердца
image
Количество пострадавших от приема японских БАДов превысило 100 человек. Есть погибшие.
image
Столичные врачи смогут определять патологии шейного отдела позвоночника с помощью ИИ-сервиса
image
В Подмосковье врачи-психиатры обсудили новые подходы в оказании психологической помощи пострадавшим в «Крокусе»
image
Минздрав РФ зарегистрировал препарат от коронавируса «МИР 19»
image
Минсельхоз расширил перечень индикаторов риска при производстве ветпрепаратов
image
«Круг добра» получил подтверждение на поставки в Россию препарата «Трикафта»
image
FDA одобрило лекарственное средство в форме таблеток против ЛАГ

Контакты

...

Фармацевтическая компания "МЕДАРГО"

 +7 495 730-55-50   mail@medargo.ru

Время работы: 9.00-18.00 МСК, Понедельник-Пятница